在完成所有准备后，为16名队员配备好装备和回路，与塞雷斯托对话选择“前往影之国”即可出发。
剧情推进后将进行分组：凯文和莉丝将与另外两名队员从大门进入；其余12名队员则分为四人一组，分别从左、右、正三个门进入。四个门最终会同时爆发BOSS战，大门的难度相对较高，其余三个门难度相近。建议每个小队都配置一名掌握全屏S技的成员和一名负责回复的人员。特别需要注意的是，如果提妲要驾驶“导力装甲”参战，请避免选择正门，因为前方的BOSS会使用具有即死效果的攻击，导力装甲无法防御；玲在面对高达系敌人时会异常兴奋；阿加特与神龙会有特殊对话等。
分组完成后即可继续前进。玩家可以自由选择左、右、正三个门的攻略顺序，只有当三个门都到达终点后，才能攻略大门。请注意，四个队伍的装备和回路是共享的，诸如“阴阳”、“阳炎”等迷宫必备回路以及回复CP的饰品等，都可以通过拆卸来重复利用。然而，由于四个门的最后一战是同时进行的，无法中途调整装备和回路，因此仍需为每位队员的最后一战准备充足的回路（防具等可以在幻影城拾取）。
首先介绍左门。每个门内都有大量最终装备，切勿遗漏。途中会遭遇中BOSS，需注意防御即死、混乱等状态；若陷入困境，此战允许逃跑，可以退出来重新调整后再战。继续前进至回复装置处，将其他队伍的回路卸下，调整好本队的装备和回路，存档后继续前进，镜头将切回幻影城入口，供玩家继续选择队伍。
接下来是右门。此处的中BOSS不会使用异常状态攻击，只需注意回复即可通过。继续前进至回复点，调整好后继续前进。镜头切回入口，此时可选择正门。
正门的中BOSS会使用混乱和气绝攻击，做好防御后便很轻松，继续前进至回复点，调整好后继续前进。
最后是大门的队伍。大门的敌人实力最强。中BOSS与左门相同，会使用即死攻击，需注意防御。到达回复点并做好最终调整后，前往大门处，剧情中选择“打开门”将触发最终的BOSS战。注意此后的连战将无法中途调整装备，建议在继续剧情前先存档。BOSS战为四连战，需由四个门的队伍分别击败各自的BOSS后才能通关。
左门BOSS为金色巨人，会使用黑暗和气绝攻击，建议开场爆发S技清场，之后集中火力消灭金色巨人即可。
右门BOSS是T-幽灵，实际上是FC版BOSS的加强版，战斗方法相似，注意及时回复，同时留意敌人的“AA抵消弹”会打断我方吟唱的魔法。
正门BOSS是神龙，需注意防御混乱和气绝。对方会使用“根源屏障”，因此本战魔法角色只能进行辅助和回血。
大门处是整个游戏最后的总BOSS——世界之意志。该BOSS在行动首回合会召唤出七个属性的圣柱，分别对应七种属性，只有对应属性的魔法以及无属性的物理攻击才能对其造成伤害。在七个柱子全部被消灭前，BOSS本体处于无敌状态，期间敌人只会使用魔法“七曜危机”，伤害会随柱子数量的减少而降低，初期七根柱子齐在时释放该魔法，若不防御很容易导致团灭。七根柱子清理完毕后即可攻击BOSS本体，此阶段BOSS会召唤小怪（小怪攻击力强，死后会自爆，并使我方人员消失），在使用“邪光波·蛇神之预言”后会紧接着使用“圣痕炮·星球之毁灭”。圣痕炮的杀伤力极强，通常只有满血的金和导力装甲状态的提妲能残留少量HP，其余角色会被满血秒杀，因此一旦对方使用邪光波后，务必给全体队员套上护盾。
本战有两种策略：第一种是在敌人召唤圣柱前将其消灭，此法通常由高手操作，作战队员多为连锁组或理查德等人，且需对AT栏有精确控制，此处不再赘述。大多数玩家的通用打法是：凯文的S技设为星杯领域，开场全员不进行物理攻击，仅使用“时间加速改”、“星之守护”或“强音之力”等魔法提升速度与攻击力。当对方召唤出七根柱子后，全员使用对应的魔法或物理攻击柱子。由于七曜危机吟唱时间很长，只要在释放前保证放出星杯领域即可。队伍中若有一名拥有全屏S技的队员，战斗会变得容易许多（注意凯文的两个攻击S技和理查德的残光破碎剑都有属性，不可随意使用）。记得多用莉丝的“圣洁祝福”为需要CP的队员补充CP。清完柱子后，确保全员时刻保持护盾状态，随后物理系角色冲到前线慢慢攻击即可确保获胜。
战斗结束后是漫长的剧情，角色间相互告别的场面非常感人（许多角色此后将不再出场，请珍惜）。游戏至此结束。